清华大学基础医学院医学数据计算平台成立于2020年,是院级实验平台,依托于基础医学院建设与管理,位于清华大学医学科学楼。
医学数据计算平台的研究方向是生物信息学,其最主要的技术特色是运用Kubernetes技术构建了私有化云平台。将控制节点,计算节点,gpu节点,存储节点等各型计算机服务器整合为一个通用的平台对外提供生物信息学计算服务。平台采用容器化的管理方式,可根据用户需求自由申请cpu,内存和gpu资源来满足个性化分析需求。平台提供的基础镜像中安装了生物信息学分析所用到的大多数软件,各种常用R包等,也支持大模型及各类机器学习的使用场景。平台针对生信分析中的作图具有良好的可视化支持,可网页形式访问rstudio,jupyter等软件,做到即时出图及编程的所见即所得。
平台的服务对象是需要使用计算资源来进行生物信息学数据分析及机器学习,大模型构建与训练的各类用户。可面向全校师生及社会需求。
平台的核心设备有接口服务器1台,控制节点3台,计算节点23台,共计包含2200多cpu核心,单台服务器内存1T,A40系列中断显卡10张,H系列最高等级显卡11张。
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