分子肿瘤学全国重点实验室是国家医学战略科技力量的重要组成部分，是建设全球癌症研究人才高地、癌症发生发展和转移复发分子机制研究的重要基地。实验室始建于1988年，原名分子肿瘤学国家重点实验室。2022年实验室积极响应党和国家重组国家重点实验室战略部署，在科技部的指导下，在原有分子肿瘤学国家重点实验室基础上，整合国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院的肿瘤大数据及临床研究团队，清华大学基础医学院、药学院、生命学院以及北京大学肿瘤学相关资源和平台，成功组建了新的分子肿瘤学全国重点实验室。实验室主要聚焦我国高发的食管癌、肺癌、乳腺癌等为研究特色，在肿瘤分子病因学与分子流行病学、肿瘤发生发展的细胞分子机制、肿瘤系统生物学、肿瘤免疫、肿瘤转化医学等方向深入开展研究，为降低发病率、提高5年生存率提供预防与早诊早治策略及创新治疗药物。
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