清华大学免疫学研究所（Institute for Immunology, Tsinghua University, IITU）成立于2014年6月， 是由清华大学医学院和生命学院共同发起创建的校级研究机构。免疫所现有教授/研究员14人，独立实验室14个，联聘实验室4个。其中中国科学院院士一名，“高端人才计划”专家5名，青年高端人才计划6名，长江学者讲座教授及特聘教授5名，国家自然科学基金委杰青4名、优青4名。免疫所研究方向涉及免疫学的各个前沿领域，例如：自身免疫疾病、免疫细胞发育及功能、天然免疫及炎症疾病、适应性免疫发生机制、感染与免疫、过敏性疾病以及肿瘤免疫治疗等。免疫所于2017年1月被认定为北京市重点实验室，实验室名称为：慢性疾病的免疫学研究北京市重点实验室。在2019年国际评估中，由七位美国科学院院士组成的评估团一致认为清华大学免疫学研究所已经引领中国和亚洲，并且极有潜力跻身世界前列。