基础医学博士研究生教育秉承清华大学价值塑造、能力培养、知识传授“三位一体”的教育理念，致力于培养具有良好的科学人文素养、宽厚扎实的生命科学与基础医学理论知识和实验技能、能够独立从事基础医学研究，且具有创新精神的专业人才。目前，我们拥有发育与再生、肿瘤、免疫、病原微生物与传染病、医学生物化学与遗传和神经生物学和神经退化性疾病等多个特色的学科方向。基础医学系师资力量雄厚，博士生导师51人，包括院士6人、国家特聘专家8人、长江特聘教授和讲座教授8人、长江青年学者3人、杰青8人、青年高端人才15人、优青7人、万人计划2人、曾任和现任973和国家重点研发计划首席6人等。基础医学系现有355名在读博士生研究生，自2012年建系以来，已培养380余名生物学博士毕业生和6名基础医学博士毕业生。
清华医学院于2019年获得教育部一级学科基础医学博士学位授权点，研究生培养一级学科开始由生物学过渡到基础医学。我们培养的基础医学博士应致力于探索生命本质和基本规律，重要的基础医学问题和前沿研究领域，对未知生命现象的认识和技术应用，能代表基础医学相关学科领域的研究方向，解决与医学、卫生和健康相关的社会需求问题，在某一研究方向、技术、或基础理论上有所突破和拓展，勇于进行原创性、高风险和颠覆性的探索型研究。基于此目标，我们着力打造一个严谨求实、开放创新、个性化孵育培养和激励性的学术氛围。
首先，在招生方面，基础医学系以基础医学为一级学科，与生命科学学院、生命科学联合中心（CLS项目清华大学）和药学院（生物学方向），简称“四方”，进行博士研究生联合招生，实行“申请―审核”择优录取制，每年分三个批次进行（7月、9月及次年3-4月）。“四方”的博士研究生入学后通过轮转定导加入基础医学系，轮转可在“四方”约130个实验室中选择进行，旨在让新生体验不同的研究方向和实验室文化，从而选择适合自己的科研兴趣和实验室。三轮轮转（每轮为期两个月）结束后，基于双向自愿选择定导。根据导师所在学科（基础医学或生物学）和所属院系确定学生的专业和学籍。比如，导师所属基础医学系的，学生专业为基础医学，学籍为医学院，需按照基础医学培养方案进行博士培养（创新成果基本要求、基础医学系基础医学培养方案、CLS项目培养方案、PTN项目培养方案）。此外，申请人也可通过申请PTN项目（即“北京大学¾清华大学¾北京生命科学研究所”联合培养博士研究生项目）加入基础医学系。同样实行“申请―审核”择优录取制，新生入学后可在以上三个单位的实验室轮转，定导导师为清华大学基础医学系的学生，其专业为基础医学，学籍为清华大学医学院。
其次，关于基础医学博士研究生培养，导师是第一责任人。同时，我们充分发挥“博士论文指导小组（ThesisCommittee）”的作用，对每位博士生在基础医学系求学期间，进行有针对性的、长期和连贯性的学术指导，帮助学生的学术和人生成长，激励学生进行探索性的科学研究。博士论文指导小组将负责博士生资格考试、年度汇报、论文工作中期检查和最终学术报告等重要培养环节的考核。考核不通过者，予以分流。对于达到博士学位要求的研究生，推荐其进入毕业流程，如博士学位论文评审。基础医学博士学位论文是申请博士学位的重要依据，学位论文评审采用“隐名送审¾评审专家选择‘隐名’或‘公开’其评审意见”相结合的方式。透明公正的评审生态体系不仅有利于学术交流，还能鼓励学生进行高风险且具革新意义的原创性科学研究。
博士研究生可申请各类国家、校级和院系级研究生奖学金，包括：国家奖学金、校设特等奖学金、校设综合优秀奖学金、校设蒋南翔奖学金、校设“一二·九”奖学金、校设“清峰”前置式奖学金等。此外，还有招生录取期间评定的“未来学者奖学金”。我们希望通过奖学金的评审，能够激励学生耐得住寂寞挑战难点，敢做原创性、颠覆性和孕育性的研究工作，进而能尽早发现并培养一批优秀博士研究生。同时，为让学生安心学习潜心研究提供保障，还设立了基本奖助金、校设助教助管津贴、院系/导师奖助金及岗位津贴等经济资助体系，和助学金、突发性困难补助、国家助学贷款、研究生新生临时贷款（“绿色通道”）、其他资助项目如大病医疗保险等应急助困体系。
另外，为营造师生平等友好和严谨开放的学术氛围，基础医学系开展了形式多样的学术交流活动。包括基础医学系师生交流会（周）、研究生学术交流（月）、基础医学博士生论坛（年）和“生命科学、基础医学和药学”联合博士生论坛（年）、以及各类学术专题论坛、及国内外学者的学术报告等。同时，我们还鼓励师生积极参加清华园内丰富多彩的文体活动，如马约翰杯运动会、毕业校园长跑、校园歌手大赛、新年联欢晚会、校园主持人大赛、师生篮球、乒乓球、羽毛球、网球和游泳比赛等。最后，基础医学博士研究生培养的一个必修环节是“社会实践”。通过在医疗卫生、新药研发、生物技术和相关国家职能部门，进行为期6周的社会实践，增强学生对本专业在社会、国情和就业形势中的了解，帮助学生拓展视野、关注国情、规划职业，提高综合竞争力。
总之，清华大学基础医学已经建立个性化精英培养体系和健康阳光的良性竞争学术生态环境。在这里，优秀的博士研究生们实现化茧成蝶的蜕变，成为有眼界、勇于担当和创新的科研领军人才，提升我国科学进步的原始创造力。欢迎加入我们！
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